Dans les étages, plus de 200 chambres étaient prévues pour le repos et les repas des marchands, alors que le rez-de-chaussée servait de dépôt et de magasin.
En 1505, un énorme incendie ravage le fondaco dei Tedeschi, qui se retrouve réduit en cendres. Le palais est reconstruit en 1508, plus grand et plus imposant, pour mettre en valeur tout autant le commerce avec la communauté allemande que son aspect artistique et culturel. Pour la décoration, les Doges font appel à deux artistes de renom : le Titien et Giorgione, qui réaliseront des fresques sur sa façade.
Aprés avoir douane sous Napoléon, et le siège de la Poste centrale de 1870 à 2008, c'est désormais un centre commercial dédié au luxe : les 7 000 m2 du bâtiment, à quelques pas du pont de Rialto, ont été investis par les boutiques du groupe Dfs, filiale de LVMH.
